12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2197 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2197  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  46.43 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  47.86 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  43.57 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2107  TonB-like protein  38.05 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.799306  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1089  TonB-like protein  35.44 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.161692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  31.33 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  29.14 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.3 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  40.91 
 
 		 2179 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  26.74 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  41.38 
 
 		 2272 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>