16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4815 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  96.77 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  74.43 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2197  hypothetical protein  46.9 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1089  TonB-like protein  38.74 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.161692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2107  TonB-like protein  34.42 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.799306  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  27.5 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  27.78 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  28.21 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  27.52 
 
 		 451 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.66 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  31.33 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2607  hypothetical protein  26.96 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  28.22 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  26.58 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>