More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1264 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  70.75 
 
 		 920 aa  1376    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 923 aa  1889    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  51.13 
 
 		 924 aa  917    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  48.07 
 
 		 945 aa  854    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 967 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 994 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  35.28 
 
 		 1109 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 1097 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  35.37 
 
 		 986 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  36.21 
 
 		 978 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 990 aa  499  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 943 aa  489  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 984 aa  489  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 958 aa  488  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 990 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 998 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 998 aa  475  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 998 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1006 aa  476  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 998 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 982 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 982 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 987 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 944 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 1008 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 961 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 919 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 1035 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 984 aa  356  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 951 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 951 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 951 aa  312  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 948 aa  289  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  47.35 
 
 		 914 aa  274  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 1017 aa  267  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 1013 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 915 aa  243  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 		 1048 aa  240  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 998 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 875 aa  231  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 927 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  27.19 
 
 		 906 aa  224  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 918 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 1011 aa  218  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.52 
 
 		 927 aa  218  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 1074 aa  210  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 931 aa  207  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 957 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 929 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 945 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 967 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  24.77 
 
 		 908 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 906 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 950 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 961 aa  179  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  23.98 
 
 		 918 aa  178  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 946 aa  177  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  23.07 
 
 		 919 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 934 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 934 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 885 aa  171  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 936 aa  171  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 911 aa  171  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 976 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 971 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 943 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 988 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 988 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  36.44 
 
 		 882 aa  152  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 941 aa  152  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 944 aa  151  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 874 aa  150  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 869 aa  151  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 942 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 984 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 870 aa  148  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 875 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 881 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 878 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 894 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 892 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 874 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 917 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 1010 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1036 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 888 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 887 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 924 aa  141  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 887 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 964 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 874 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 859 aa  140  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 900 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 872 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  28.29 
 
 		 960 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 1047 aa  137  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>