More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0321 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 934 aa  1910    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 951 aa  290  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 951 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 961 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 951 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 919 aa  267  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 1097 aa  266  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 943 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 948 aa  262  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  26.95 
 
 		 1109 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 958 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 976 aa  237  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 934 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 1007 aa  224  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.42 
 
 		 960 aa  224  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1047 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 964 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 967 aa  221  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 984 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  25.12 
 
 		 986 aa  216  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 904 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 1074 aa  214  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 868 aa  214  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 908 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 868 aa  214  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 906 aa  213  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 921 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 914 aa  211  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 912 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 908 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 924 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 902 aa  209  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 978 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25 
 
 		 908 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 998 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 988 aa  204  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 988 aa  204  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 926 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25 
 
 		 940 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 920 aa  202  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  25.22 
 
 		 959 aa  200  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 945 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 922 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 990 aa  197  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1013 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 921 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1010 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 908 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 967 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 923 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 874 aa  190  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  25.6 
 
 		 927 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 940 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.77 
 
 		 908 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 929 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 870 aa  189  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.67 
 
 		 908 aa  188  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.47 
 
 		 941 aa  188  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 945 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 1008 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  24.05 
 
 		 919 aa  185  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.4 
 
 		 942 aa  184  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 1016 aa  184  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 939 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 982 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 982 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 939 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 943 aa  180  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 958 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.28 
 
 		 836 aa  174  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 990 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 994 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 901 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 918 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 936 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 974 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1279  rhodanese-like protein  24.9 
 
 		 990 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 994 aa  167  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 1006 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 938 aa  163  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 901 aa  163  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 1035 aa  162  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 936 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 924 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  24.18 
 
 		 918 aa  158  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 984 aa  158  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 946 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 961 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 950 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  30.5 
 
 		 978 aa  152  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 971 aa  150  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 1017 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1013 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 875 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 1011 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1046 aa  144  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 927 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 925 aa  142  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 964 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>