190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01700 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01700  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  49.64 
 
 		 904 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 921 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 912 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 901 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 885 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 908 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 915 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 894 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 875 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 859 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 908 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  29.91 
 
 		 918 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 927 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 976 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  29.55 
 
 		 908 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  28.12 
 
 		 908 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 908 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  28.12 
 
 		 908 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 880 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  29.54 
 
 		 919 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 906 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 878 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 878 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 878 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 878 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 942 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  27.67 
 
 		 960 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 919 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 939 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 939 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 951 aa  92  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  29.35 
 
 		 940 aa  92  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 945 aa  92  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 951 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 951 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 940 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 1007 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 931 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  27.88 
 
 		 941 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 911 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 921 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 925 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 918 aa  86.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 906 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  26.3 
 
 		 970 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 881 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 988 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 874 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 929 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 988 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 874 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 868 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 984 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 868 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 948 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 872 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 926 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 881 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 888 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1016 aa  79.7  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 875 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 934 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 947 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  27.33 
 
 		 906 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 880 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 924 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 943 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 870 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1047 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 874 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 869 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 746 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 888 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  26.84 
 
 		 959 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 902 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 900 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 845 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 892 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 1240 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 972 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 946 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 946 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 1036 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 922 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 887 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 882 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 887 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 978 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 889 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 938 aa  69.3  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1048 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 914 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 853 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 892 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 957 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 943 aa  65.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  22.8 
 
 		 1210 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1097 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  24.65 
 
 		 968 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>