257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03867 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 977 aa  1991    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  50.74 
 
 		 979 aa  921    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 918 aa  266  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 929 aa  221  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 915 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 922 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  25.35 
 
 		 906 aa  183  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 945 aa  172  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 931 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 957 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 945 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 982 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 982 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 927 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 1009 aa  150  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 868 aa  141  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  24 
 
 		 954 aa  141  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 948 aa  140  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 892 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 925 aa  139  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 868 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 875 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 875 aa  134  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 933 aa  131  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 859 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 951 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 951 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 943 aa  130  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 951 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 904 aa  129  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1021  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 845 aa  128  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 874 aa  128  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 984 aa  127  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 870 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 1036 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 880 aa  126  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  30.08 
 
 		 927 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  34.87 
 
 		 1109 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 869 aa  124  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 1047 aa  124  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 872 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  28.76 
 
 		 986 aa  121  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 958 aa  121  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 878 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 936 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 878 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 878 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 878 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 936 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.17 
 
 		 918 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 1097 aa  118  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 945 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 902 aa  117  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 950 aa  117  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 892 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 961 aa  116  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 990 aa  116  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  40.21 
 
 		 271 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 888 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 880 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 919 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 894 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 874 aa  115  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1035 aa  115  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 1008 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 944 aa  114  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1843  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 1083 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000198025  decreased coverage  0.000327731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0809  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 1218 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00325409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 961 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 943 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 993 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 888 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 900 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 990 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1007 aa  111  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 889 aa  111  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  33.6 
 
 		 908 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 881 aa  110  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  33.5 
 
 		 978 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 958 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 887 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 926 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 		 1011 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.13 
 
 		 968 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 984 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 887 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 882 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 934 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 908 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 1006 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  38.98 
 
 		 908 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1017 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 967 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  38.98 
 
 		 908 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 923 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 924 aa  105  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  38.42 
 
 		 908 aa  104  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  29.2 
 
 		 959 aa  104  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>