240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2991 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 1013 aa  2071    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  45.46 
 
 		 1011 aa  809    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 963 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  35.51 
 
 		 970 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1046 aa  469  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 908 aa  274  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  25.92 
 
 		 959 aa  263  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 940 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  26.23 
 
 		 940 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.97 
 
 		 942 aa  243  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1007 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.81 
 
 		 960 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 939 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 939 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  26.54 
 
 		 941 aa  237  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 1010 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 915 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 988 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 988 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 894 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 976 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 904 aa  210  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 901 aa  208  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 885 aa  205  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 921 aa  204  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1016 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 945 aa  199  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 912 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 948 aa  196  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  26.12 
 
 		 836 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 921 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 943 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  24.19 
 
 		 908 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 920 aa  183  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 958 aa  184  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 934 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 908 aa  182  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.14 
 
 		 908 aa  182  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 951 aa  181  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 951 aa  181  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 951 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 931 aa  178  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 946 aa  177  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 1013 aa  171  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 929 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 958 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 878 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 878 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 918 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 878 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 878 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 1009 aa  164  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  29.4 
 
 		 919 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  28.04 
 
 		 918 aa  162  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 1097 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  27.85 
 
 		 908 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  24.14 
 
 		 927 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 906 aa  155  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 998 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 908 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 998 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 998 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 979 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 964 aa  150  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 906 aa  148  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 957 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 943 aa  137  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 944 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  31.53 
 
 		 312 aa  135  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 993 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 987 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 1011 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 838 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 911 aa  128  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 938 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  38.42 
 
 		 1109 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 934 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 961 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 978 aa  123  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3818  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 974 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.003378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 923 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 924 aa  121  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 1158 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  26.62 
 
 		 986 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 914 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  21.08 
 
 		 1074 aa  119  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  29.12 
 
 		 906 aa  119  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 888 aa  117  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02628  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 967 aa  115  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 1017 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 1006 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 1035 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 971 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 882 aa  111  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 900 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 924 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 881 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 961 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 927 aa  110  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  30.12 
 
 		 954 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>