More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3041 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  58.39 
 
 		 929 aa  1039    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 931 aa  1893    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  56.26 
 
 		 957 aa  1040    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  42.27 
 
 		 918 aa  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  35.68 
 
 		 906 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 933 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 894 aa  326  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 925 aa  260  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 878 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 878 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 878 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 878 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 951 aa  252  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 859 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 951 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 951 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 1013 aa  242  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 892 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 915 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1035 aa  234  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 948 aa  232  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 920 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 914 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1047 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 869 aa  224  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 919 aa  222  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 979 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 882 aa  218  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 881 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 875 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  25.82 
 
 		 940 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 887 aa  214  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 887 aa  214  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 924 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 900 aa  211  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 984 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 923 aa  207  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 922 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 836 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 868 aa  207  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  27.23 
 
 		 838 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 868 aa  203  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 885 aa  201  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  25.73 
 
 		 960 aa  201  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 939 aa  200  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 939 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 911 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 947 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  24.77 
 
 		 941 aa  197  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 940 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 964 aa  194  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 936 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 943 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 942 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  24.36 
 
 		 972 aa  184  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  25.16 
 
 		 919 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 881 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 901 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 912 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  25.71 
 
 		 836 aa  178  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1013 aa  177  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 945 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 958 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  38.44 
 
 		 1109 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 902 aa  172  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 838 aa  170  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  23.79 
 
 		 970 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  36.51 
 
 		 943 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 1097 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 977 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  37.3 
 
 		 986 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 936 aa  168  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 936 aa  167  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 961 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  38.57 
 
 		 961 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 934 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 853 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  26.75 
 
 		 1210 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 1006 aa  157  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 990 aa  157  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 927 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 875 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 987 aa  155  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 1011 aa  154  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1240 aa  151  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 1013 aa  150  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 1036 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 994 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02198  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 1048 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 1017 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  32.26 
 
 		 918 aa  148  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  36.1 
 
 		 978 aa  148  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 990 aa  146  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 998 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 945 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2410  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 926 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 938 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 943 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 982 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 982 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>