199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00303 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00303  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.095316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  59.03 
 
 		 853 aa  140  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  48.31 
 
 		 901 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  44.21 
 
 		 838 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 945 aa  80.5  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 934 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1397  TonB-dependent receptor  39.17 
 
 		 1008 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0795822  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  45.95 
 
 		 943 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 		 936 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 917 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  49.33 
 
 		 836 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  46.43 
 
 		 842 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  52.78 
 
 		 972 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 964 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  45.07 
 
 		 943 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 990 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  45.07 
 
 		 941 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  45.07 
 
 		 944 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  45.07 
 
 		 942 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 1006 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 859 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 943 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 982 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 982 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  41.77 
 
 		 870 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1136  TonB-dependent receptor  44 
 
 		 892 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1097  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 869 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  35.04 
 
 		 986 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  51.67 
 
 		 994 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 998 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1072  TonB-dependent receptor, plug  45.71 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 874 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3514  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 874 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  51.67 
 
 		 914 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  39.09 
 
 		 1034 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03903  TonB-dependent receptor  41.46 
 
 		 1074 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  44 
 
 		 888 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  44 
 
 		 872 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 868 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  33.62 
 
 		 978 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 967 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 919 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 875 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  40.7 
 
 		 1036 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 962 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 961 aa  70.5  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1603  TonB-dependent receptor  37.96 
 
 		 990 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 1013 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  42.67 
 
 		 874 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 927 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  43.24 
 
 		 880 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 1011 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 964 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 		 957 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4286  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1013 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00048068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 875 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 951 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 998 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  37.84 
 
 		 992 aa  68.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 868 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  39.29 
 
 		 900 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 948 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 1097 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 915 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 933 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1263  TonB-dependent receptor  38.82 
 
 		 920 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000516737  unclonable  0.0000000262574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  48.33 
 
 		 1109 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  40.79 
 
 		 958 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 945 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 951 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 951 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 938 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 		 894 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  48.33 
 
 		 998 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1264  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 923 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000254862  unclonable  0.0000000223641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 882 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 929 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  48.33 
 
 		 998 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 936 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 936 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  48.33 
 
 		 998 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  49.15 
 
 		 944 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  34.51 
 
 		 906 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2831  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 1017 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312768  hitchhiker  0.00196838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  43.55 
 
 		 1035 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  39.81 
 
 		 994 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 940 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 931 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 918 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 881 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 924 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  47.3 
 
 		 935 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 887 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 887 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3698  TonB-dependent receptor  38.16 
 
 		 961 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 1047 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 972 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 892 aa  63.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0914  TonB-dependent receptor  44.62 
 
 		 987 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  38.16 
 
 		 919 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>