295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1492 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1492  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 977 aa  2008    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 862 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  26.01 
 
 		 897 aa  188  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  25.31 
 
 		 838 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 746 aa  131  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 853 aa  109  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1862  TonB-dependent receptor plug  22.18 
 
 		 947 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.248067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 859 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 894 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 961 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 918 aa  95.5  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 902 aa  95.5  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 972 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 914 aa  92.8  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 888 aa  92.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 918 aa  92  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 919 aa  91.3  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 922 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 943 aa  90.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0952  ribosomal protein L17  24.05 
 
 		 906 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000237948  hitchhiker  0.00000537684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 885 aa  89.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 917 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 957 aa  89  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  21.95 
 
 		 941 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1850  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 1035 aa  87.8  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922391  normal  0.182399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 941 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 944 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 943 aa  84  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  32.63 
 
 		 972 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 942 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 915 aa  82  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 945 aa  81.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  39.52 
 
 		 901 aa  81.3  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 946 aa  80.1  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 875 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 962 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 836 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 951 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00017  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 1036 aa  77.8  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.000000000276656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 951 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2168  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 868 aa  76.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 1007 aa  76.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2261  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 868 aa  76.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.342562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 948 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 951 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1773  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 1047 aa  75.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.133871  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  36.36 
 
 		 992 aa  75.5  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 935 aa  75.1  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  30.04 
 
 		 940 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 936 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 984 aa  72.8  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04315  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 838 aa  72.8  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 984 aa  72.4  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 880 aa  72.4  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 938 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3686  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 919 aa  72  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00016445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 943 aa  71.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2126  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 986 aa  71.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593846  normal  0.258054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02336  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 889 aa  71.2  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0825116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 925 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 842 aa  70.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 964 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 927 aa  69.3  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2942  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 887 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201081  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 934 aa  67.4  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 878 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 878 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 931 aa  67.4  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0809  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 1218 aa  67.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00325409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 878 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 900 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3121  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 887 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 939 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 939 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  23.09 
 
 		 894 aa  66.6  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 875 aa  65.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 979 aa  66.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 963 aa  65.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03867  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 977 aa  65.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 994 aa  65.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 878 aa  65.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 961 aa  65.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 958 aa  65.1  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 990 aa  65.1  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1399  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 967 aa  64.7  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 964 aa  65.1  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 921 aa  65.1  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 943 aa  64.7  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2995  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 933 aa  64.7  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 912 aa  64.7  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3024  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 874 aa  64.7  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 976 aa  64.7  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1112  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 874 aa  64.3  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 950 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1208  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 870 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.888079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1097 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 994 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>