More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0454 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 807 aa  1649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 744 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 766 aa  303  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  30.52 
 
 		 747 aa  287  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 738 aa  277  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 789 aa  275  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 730 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 794 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 757 aa  250  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 812 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 758 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 775 aa  238  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 759 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 723 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 808 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 796 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 720 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 803 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 761 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 783 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 767 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 860 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.25 
 
 		 739 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 743 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 726 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 784 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 782 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 759 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 737 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 769 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 780 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 771 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 777 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 784 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 728 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 763 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 756 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 735 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  26.25 
 
 		 797 aa  202  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 790 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 804 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 746 aa  201  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 743 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 859 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 867 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 726 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 732 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 856 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 796 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 832 aa  193  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 796 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 851 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 919 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 787 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 771 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 747 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 764 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 725 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 741 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 786 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 757 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 790 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 753 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 785 aa  187  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 743 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 765 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 700 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 779 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 734 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 755 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 758 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 764 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 755 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 809 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 722 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 758 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 749 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 761 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 776 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 792 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 822 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 840 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 717 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 797 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 771 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 751 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 771 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 733 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 722 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.56 
 
 		 715 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  24.39 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 769 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>