More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4129 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 767 aa  1557    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  44.12 
 
 		 785 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  45.2 
 
 		 779 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  42.32 
 
 		 764 aa  614  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  43.71 
 
 		 809 aa  598  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  42.07 
 
 		 795 aa  588  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  41.24 
 
 		 784 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  42.29 
 
 		 790 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  39.61 
 
 		 773 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 822 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 810 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 777 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 863 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 771 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 755 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 720 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 763 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 756 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 732 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 734 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 758 aa  247  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 751 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 743 aa  231  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 763 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 782 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 730 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 780 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 809 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 730 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 790 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 746 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 777 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 761 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 765 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 825 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 710 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 728 aa  211  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 783 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 755 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 737 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 743 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 733 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 766 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.04 
 
 		 748 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 857 aa  204  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 769 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 761 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 792 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 764 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 779 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 748 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27 
 
 		 739 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 722 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 803 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 791 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 790 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 753 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 732 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 736 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 735 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 802 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 786 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 797 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 741 aa  191  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 780 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 741 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 864 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 838 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 780 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 809 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 785 aa  188  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 856 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 700 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 758 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 725 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 794 aa  184  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 731 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 775 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 763 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 744 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 759 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 771 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 757 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 812 aa  177  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 754 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 832 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 754 aa  177  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 717 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>