More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4350 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 743 aa  1512    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  64.74 
 
 		 733 aa  942    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  62.86 
 
 		 730 aa  904    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 774 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 789 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 779 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  33.68 
 
 		 789 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 782 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 773 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 767 aa  342  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 772 aa  340  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 764 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 755 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 704 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 756 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 730 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 790 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 771 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 761 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 763 aa  273  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 755 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 720 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 765 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 759 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.72 
 
 		 739 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 803 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 737 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 729 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 758 aa  250  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 747 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 792 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 773 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 764 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 771 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 726 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 790 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 777 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 773 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 766 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 808 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 780 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 743 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 725 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 722 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 807 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 780 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 783 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 769 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 723 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 732 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 758 aa  227  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 796 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 794 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 822 aa  224  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 746 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 713 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 775 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 731 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 748 aa  216  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 864 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 749 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 728 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 786 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 795 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 784 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 744 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 785 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 751 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 773 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 808 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 734 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 790 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 789 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 791 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 722 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 733 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 757 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 700 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 767 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 702 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 810 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 817 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 794 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 764 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 856 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 731 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 743 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 757 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 771 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 736 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 758 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 838 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>