More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0765 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 779 aa  1581    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 730 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 743 aa  389  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 782 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  37.46 
 
 		 733 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 774 aa  369  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 764 aa  350  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  32.64 
 
 		 789 aa  344  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 789 aa  331  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 773 aa  324  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 763 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 704 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 772 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 726 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 767 aa  286  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 771 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 700 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 761 aa  273  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 746 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 759 aa  271  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 730 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 761 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 790 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 710 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 720 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 758 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 803 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 765 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 766 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 741 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 775 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 796 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 737 aa  243  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 757 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 780 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 722 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 773 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.85 
 
 		 739 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 723 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 822 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 756 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 734 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 726 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 783 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 785 aa  231  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 817 aa  230  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 743 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 725 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.55 
 
 		 755 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 713 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 776 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 732 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 807 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 792 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 796 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 755 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 722 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 730 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 784 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 744 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 773 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.64 
 
 		 797 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 764 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 857 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 775 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 728 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 731 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 771 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 777 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 851 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 780 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 789 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 859 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 777 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 773 aa  208  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 784 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 795 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 860 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 764 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 787 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 741 aa  204  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 735 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 702 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 733 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 751 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 790 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 856 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 738 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 812 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 769 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 790 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 736 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 767 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>