More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3771 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  59.77 
 
 		 784 aa  952    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 794 aa  1616    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  38.07 
 
 		 787 aa  525  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 784 aa  323  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 804 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 761 aa  308  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 790 aa  306  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 779 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 792 aa  298  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 790 aa  290  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 753 aa  289  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 775 aa  288  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 853 aa  288  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 860 aa  288  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  30.78 
 
 		 807 aa  287  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 763 aa  286  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  30.71 
 
 		 797 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 780 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 730 aa  279  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 803 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 851 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 856 aa  275  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 858 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 817 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 783 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 759 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 755 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 759 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 771 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 867 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.01 
 
 		 739 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 732 aa  260  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 751 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 786 aa  255  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 704 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 780 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 720 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 758 aa  250  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 750 aa  250  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 780 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 786 aa  249  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 710 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 763 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 745 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 859 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 726 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 799 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 807 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 728 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 832 aa  238  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  27.69 
 
 		 850 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 785 aa  238  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 736 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 774 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 765 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 733 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 729 aa  231  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 808 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 741 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 764 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 855 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 766 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 803 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 775 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 817 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 771 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 777 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 728 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 722 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 814 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 757 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 825 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 747 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.89 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 848 aa  211  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 726 aa  210  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 749 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 746 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 		 754 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 809 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 776 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 796 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 758 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 796 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 794 aa  204  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 756 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 751 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 724 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 758 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>