More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3816 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 789 aa  1600    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  70.63 
 
 		 789 aa  1095    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 743 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 730 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 779 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  31.76 
 
 		 733 aa  335  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 782 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 772 aa  294  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 774 aa  293  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 764 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 767 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 763 aa  238  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 773 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 743 aa  234  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 756 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 710 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 755 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 759 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 722 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 790 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 761 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 729 aa  212  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 765 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 726 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 737 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 771 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 764 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 700 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 748 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 851 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 795 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 792 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 758 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 758 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 822 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 741 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 746 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 766 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 722 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 794 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 704 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 755 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 736 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.62 
 
 		 739 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 862 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 780 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 761 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 796 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 747 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 803 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 777 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 780 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 790 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 735 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 758 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 775 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 764 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 713 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 769 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 695 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 786 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 747 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 725 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 797 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 809 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 745 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 751 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 764 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 843 aa  167  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 754 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 919 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 755 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 794 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  27.29 
 
 		 776 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 713 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 896 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.42 
 
 		 754 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 731 aa  162  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 771 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 733 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 776 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 809 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 807 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 824 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 769 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>