More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1534 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 771 aa  1586    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 763 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 756 aa  356  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 758 aa  334  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 759 aa  333  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 755 aa  330  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 704 aa  323  7e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 777 aa  317  7e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 773 aa  310  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 790 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 730 aa  299  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 809 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 773 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 785 aa  295  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 720 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 810 aa  293  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 822 aa  290  9e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 779 aa  288  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 723 aa  283  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 743 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 767 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 764 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 743 aa  276  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 779 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 747 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 761 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 774 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 764 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 725 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 782 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 765 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 732 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 737 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 857 aa  257  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 726 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.64 
 
 		 739 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 767 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 710 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 784 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 758 aa  251  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 771 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 748 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 773 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 757 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 722 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 773 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 746 aa  244  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 785 aa  244  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 803 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 733 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 780 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 734 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 713 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 784 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 743 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 771 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 790 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 794 aa  239  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 791 aa  238  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 751 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 728 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 731 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 741 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 829 aa  235  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 772 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 794 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 735 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 780 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 776 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 700 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 783 aa  230  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 789 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 755 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 729 aa  228  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 753 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 738 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 758 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 764 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.04 
 
 		 797 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 749 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 777 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 775 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 744 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 787 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 769 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 722 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 792 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 807 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 724 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 856 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 808 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 758 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 730 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 761 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 717 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 764 aa  211  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 832 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>