More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4214 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 726 aa  1462    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 730 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  42.78 
 
 		 726 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 		 722 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  39.31 
 
 		 722 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 771 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 704 aa  300  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 730 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 717 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 758 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 710 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 763 aa  283  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 736 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 732 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 720 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 749 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 725 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 726 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 741 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 739 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 755 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 790 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 731 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 747 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 738 aa  255  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 779 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 762 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 792 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 767 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 780 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 803 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 761 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 780 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 773 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 776 aa  241  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 759 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 765 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.36 
 
 		 759 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 695 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.75 
 
 		 755 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 734 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 728 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 794 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 766 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 745 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 728 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 771 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 756 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 780 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 733 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 773 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 730 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 729 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 730 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 785 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 853 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 773 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 771 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 759 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 757 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 764 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 741 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 746 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 782 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 761 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 700 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  29.56 
 
 		 797 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 755 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 796 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 723 aa  218  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 713 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 750 aa  216  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 735 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 769 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 737 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.94 
 
 		 754 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 783 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 744 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 755 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 771 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 780 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 758 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 838 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 733 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 788 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 741 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 804 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 743 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 777 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 764 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 807 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 753 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 807 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 822 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 731 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 779 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 825 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 743 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>