More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3403 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 731 aa  1489    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 704 aa  246  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 755 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 783 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 722 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 771 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 780 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 759 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 780 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 751 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 739 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 744 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.08 
 
 		 747 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.16 
 
 		 759 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 702 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 763 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 784 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 741 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 759 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 700 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 743 aa  190  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 690 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 794 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 758 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 776 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 710 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 796 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 690 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 722 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 758 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 730 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 757 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 695 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 773 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 764 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 737 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 713 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.67 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 767 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 734 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 730 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 749 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 732 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 799 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 775 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 825 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 736 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 745 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 802 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 771 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 773 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 754 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 779 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 735 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  24.64 
 
 		 797 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 795 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 725 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 747 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 754 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 786 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 746 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 743 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 728 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 769 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 757 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 808 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 771 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 733 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 724 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 730 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 764 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 789 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 774 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 733 aa  159  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 794 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 784 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 786 aa  157  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 717 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.55 
 
 		 741 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 809 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 937 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.94 
 
 		 715 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 775 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 794 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 728 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 753 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 785 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 731 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.93 
 
 		 784 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 757 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 732 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 809 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>