More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1977 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 741 aa  1528    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 777 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 758 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 822 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 790 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 771 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 767 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 756 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 764 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 863 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 795 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 779 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 809 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 785 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 759 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 761 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 765 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 704 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 755 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 751 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 784 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 722 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 725 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 771 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 773 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 775 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 810 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 773 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 769 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 731 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 695 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 737 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 743 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 758 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 730 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 720 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 773 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 700 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 809 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 743 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 743 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 741 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 736 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 747 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 742 aa  144  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 728 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 761 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  22.91 
 
 		 754 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 753 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 733 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 755 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 791 aa  140  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 780 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 710 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 779 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 762 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.03 
 
 		 739 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 803 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 749 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 730 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 789 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 726 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 785 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 776 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 786 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 790 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 807 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 713 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  23.91 
 
 		 733 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 690 aa  131  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 726 aa  130  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 763 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  22.77 
 
 		 797 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 782 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 780 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 771 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 796 aa  128  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 722 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 745 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 794 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 776 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 733 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 761 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  23.99 
 
 		 789 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 690 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 763 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 783 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 767 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 851 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 720 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 853 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 731 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 757 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 825 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 746 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>