More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2300 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 730 aa  1471    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  43.93 
 
 		 726 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  41.98 
 
 		 726 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 722 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 771 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 722 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  33.75 
 
 		 739 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 726 aa  307  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 717 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 704 aa  287  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 763 aa  284  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 710 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 749 aa  280  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 730 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 741 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 784 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 758 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 725 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 720 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 765 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 780 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 796 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 755 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 736 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 794 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 723 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 734 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 737 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 747 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 753 aa  231  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 744 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 743 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 743 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 755 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 822 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 786 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 761 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 728 aa  223  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 766 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 758 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 759 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 758 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 732 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 796 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 817 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 750 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 758 aa  220  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 785 aa  220  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 864 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 695 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 779 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 803 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 788 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 838 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 757 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 731 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 767 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 773 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 784 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 735 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 756 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 745 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 858 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 782 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 787 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 757 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 759 aa  211  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 748 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 746 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 825 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 764 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 702 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 919 aa  207  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 792 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  28.34 
 
 		 763 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 856 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 758 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 769 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 789 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 731 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 814 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 779 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 728 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 713 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 730 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 729 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 790 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 		 759 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>