More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2088 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 764 aa  1551    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 720 aa  343  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 732 aa  328  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 729 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 765 aa  296  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 783 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 778 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 784 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 778 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 758 aa  277  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 758 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 759 aa  273  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 803 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 758 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 767 aa  271  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 730 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 710 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 851 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 758 aa  266  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 762 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 798 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 803 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 783 aa  262  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 761 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 761 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 867 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 788 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 728 aa  258  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 780 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 800 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 800 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 790 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 780 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 803 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 775 aa  250  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 776 aa  250  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 747 aa  250  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 771 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 777 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 786 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 750 aa  248  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 792 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 763 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 741 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 726 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 780 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 755 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 804 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 723 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.54 
 
 		 759 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 741 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 755 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 790 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.46 
 
 		 739 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 856 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 790 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 734 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 751 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 732 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 755 aa  231  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 		 751 aa  230  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 794 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 769 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 774 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 736 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 722 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 737 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 797 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 787 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 695 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 786 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 738 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 730 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 779 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 766 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 771 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 745 aa  217  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 771 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 774 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 809 aa  216  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 771 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 817 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 773 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 807 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 713 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 773 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 790 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 862 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 772 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  27.08 
 
 		 839 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>