More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0760 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 746 aa  1516    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 764 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 743 aa  353  5.9999999999999994e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 737 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 748 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 725 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 794 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 763 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 779 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 775 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 803 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 759 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 773 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 767 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 730 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 773 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 771 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 773 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 771 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 758 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 724 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 720 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 784 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 756 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 704 aa  237  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 771 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 747 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 741 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  30.04 
 
 		 733 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 749 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 789 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 753 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 783 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 784 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 710 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 743 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 700 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 726 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 723 aa  221  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 722 aa  221  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 822 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.76 
 
 		 739 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 722 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 767 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 777 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 755 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 736 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 755 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 856 aa  214  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 774 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 809 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 764 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 766 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 790 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 773 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 734 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 759 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 796 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 790 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 755 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 785 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 758 aa  205  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 777 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 780 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 732 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 758 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.41 
 
 		 748 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 785 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 896 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 758 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 726 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 776 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 786 aa  201  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 794 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 769 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 713 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 761 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 745 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 731 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 758 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 720 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 733 aa  196  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 764 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 775 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 779 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 829 aa  194  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 807 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.41 
 
 		 759 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  28.09 
 
 		 789 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>