More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1908 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 755 aa  1528    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 817 aa  303  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 765 aa  268  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 761 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 759 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 726 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 730 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 787 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 784 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 784 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 755 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 704 aa  243  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 776 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 763 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 790 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 775 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 775 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 728 aa  237  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 780 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 720 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 803 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.59 
 
 		 739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 722 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 792 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 790 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 745 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 766 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 725 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 754 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 783 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 730 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 722 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 794 aa  224  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 729 aa  224  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 777 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 747 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 806 aa  219  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 750 aa  216  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 780 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 746 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 		 759 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 737 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 832 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 		 763 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 851 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 723 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 785 aa  210  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.16 
 
 		 748 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 771 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 795 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 732 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 743 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 764 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 744 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 759 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.99 
 
 		 715 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 736 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 762 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 738 aa  200  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 764 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.79 
 
 		 755 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 780 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 773 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 771 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 769 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 758 aa  197  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 773 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 774 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 735 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 858 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 808 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 809 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 		 799 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 758 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 731 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 797 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 796 aa  190  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 807 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 734 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 773 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 758 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 789 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 854 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 753 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 779 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 779 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 777 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 779 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 724 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>