More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1063 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1580    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 809 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 825 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 743 aa  290  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 761 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 780 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.88 
 
 		 754 aa  274  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 792 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 790 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 728 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 733 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 755 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 763 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 745 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 790 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 785 aa  258  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 803 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.99 
 
 		 748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 761 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 786 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 794 aa  254  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 786 aa  253  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  30.82 
 
 		 759 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 776 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 759 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 741 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 722 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 787 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 860 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 832 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 775 aa  240  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.92 
 
 		 739 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 734 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 780 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 807 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 758 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 771 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 765 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 729 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 817 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 722 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 784 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 750 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 730 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 710 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 720 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 867 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 764 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 783 aa  224  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.33 
 
 		 747 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 749 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 730 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 726 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 770 aa  223  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 725 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 759 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 738 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.26 
 
 		 751 aa  221  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 771 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 758 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 730 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 796 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 747 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 753 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 763 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 774 aa  217  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 784 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 769 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 723 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 797 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 731 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 756 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 782 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 762 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 771 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 779 aa  214  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 753 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 794 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 773 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 777 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.41 
 
 		 755 aa  211  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 720 aa  211  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 758 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 773 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 726 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 788 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 732 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 769 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 758 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 808 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 851 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 792 aa  204  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 732 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>