More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2576 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 783 aa  1615    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 769 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 803 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 793 aa  299  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 776 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 779 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 780 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 776 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 775 aa  265  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 780 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 767 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 764 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 778 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 778 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 803 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 732 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 704 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 762 aa  230  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 786 aa  228  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 720 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 839 aa  220  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 777 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 824 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 747 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 774 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 790 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 790 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 790 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 758 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 862 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 729 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 777 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.13 
 
 		 715 aa  212  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 765 aa  212  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 840 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 726 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 792 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 838 aa  211  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 790 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 817 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 794 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 803 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.58 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  26.89 
 
 		 906 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 761 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 767 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  26.89 
 
 		 809 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 741 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 710 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 864 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 713 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 780 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 749 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 860 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 795 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 758 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 761 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 800 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 800 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 873 aa  200  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 773 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.18 
 
 		 739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 734 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 750 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 853 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 822 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 745 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 741 aa  197  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 851 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 843 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 722 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 736 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 792 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 763 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 783 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 769 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 773 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 755 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 730 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 771 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 759 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 730 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 776 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 903 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 722 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 690 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 798 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 815 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 751 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 810 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 771 aa  191  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 748 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 783 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 851 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 758 aa  190  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>