More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2843 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1602    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  36.38 
 
 		 777 aa  449  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 783 aa  276  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 778 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 778 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 767 aa  262  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 783 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 803 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 786 aa  257  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 880 aa  254  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 		 839 aa  249  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  30.31 
 
 		 741 aa  248  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 764 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 723 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 864 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 790 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 790 aa  240  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  29.28 
 
 		 751 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 747 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 800 aa  237  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 800 aa  237  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 793 aa  237  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 704 aa  237  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 862 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 729 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 919 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 803 aa  224  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 722 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.59 
 
 		 739 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 720 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 838 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 732 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 799 aa  218  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 776 aa  216  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 815 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 769 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 804 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 776 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 803 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 759 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 758 aa  208  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 726 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 771 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 736 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 862 aa  205  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 758 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 755 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 749 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 758 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 761 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 710 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 765 aa  200  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 731 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 762 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 755 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 761 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 730 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.08 
 
 		 755 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 796 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 774 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 734 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 765 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 754 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 797 aa  194  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 741 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 750 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 773 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 825 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 758 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 751 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 717 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 728 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 758 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 798 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 792 aa  187  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 765 aa  187  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 773 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 757 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 722 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 857 aa  184  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 728 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 788 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 835 aa  183  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 780 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 807 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 775 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 808 aa  180  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 761 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 737 aa  180  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 766 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 777 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 779 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.82 
 
 		 715 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  26.08 
 
 		 807 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 860 aa  177  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>