More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4039 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  46.45 
 
 		 756 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 758 aa  1550    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  39.35 
 
 		 755 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 771 aa  334  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 777 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 730 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 763 aa  271  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 857 aa  265  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 773 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 790 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 767 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 739 aa  250  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 743 aa  250  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 773 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 791 aa  248  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 767 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 764 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 726 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 774 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 790 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 822 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.44 
 
 		 733 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 783 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 729 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 746 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 785 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 785 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 759 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 720 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 764 aa  236  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 810 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 779 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 782 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 747 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 722 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 734 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 795 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 779 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 732 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 761 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 860 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 741 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 794 aa  226  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 769 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 769 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 790 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 772 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 784 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 809 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 783 aa  219  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 704 aa  219  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 723 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 780 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 748 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 771 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 761 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 710 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 		 797 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 773 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 741 aa  212  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 803 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 765 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 773 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.05 
 
 		 748 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 749 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 793 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 859 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 762 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 777 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 780 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 780 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 838 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 731 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 757 aa  204  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 776 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 867 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 737 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 789 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 808 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 817 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 769 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 803 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 764 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 803 aa  197  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 776 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  25.19 
 
 		 789 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 775 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 778 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 780 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  24.36 
 
 		 754 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 695 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>