More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1676 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 759 aa  1543    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 735 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 789 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 808 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 794 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 744 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 747 aa  254  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 730 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 738 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 758 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 796 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 757 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 780 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 722 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 761 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 710 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 807 aa  224  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 784 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 729 aa  221  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 749 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 722 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 743 aa  216  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 737 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 769 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 726 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 741 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.5 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 726 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 726 aa  204  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 748 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 717 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.95 
 
 		 739 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 803 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 731 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 769 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 720 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 730 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 730 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 731 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 777 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 765 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 728 aa  194  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 732 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 731 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 734 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 767 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 761 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 713 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 741 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 763 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 761 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 779 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 753 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 767 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 803 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 759 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 753 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 728 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 764 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 785 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 723 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 774 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 792 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 695 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 776 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 783 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.81 
 
 		 759 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 773 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 790 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 730 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 741 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 734 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.26 
 
 		 715 aa  171  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.49 
 
 		 748 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 743 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  26.55 
 
 		 763 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 743 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 794 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 825 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 788 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 758 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 750 aa  167  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 764 aa  167  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 814 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 779 aa  167  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 757 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 713 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 775 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 775 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  25.98 
 
 		 738 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 778 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 700 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 769 aa  164  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 765 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>