More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3778 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 822 aa  1679    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  61.59 
 
 		 810 aa  980    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 764 aa  432  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 767 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 773 aa  419  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 779 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 785 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 795 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 784 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 809 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 790 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 777 aa  353  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 755 aa  290  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 771 aa  290  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 769 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 763 aa  283  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 730 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 739 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 756 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 722 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 741 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 758 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 737 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 726 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 736 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 782 aa  232  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 777 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 704 aa  231  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 710 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 779 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 720 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 864 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 919 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 728 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 857 aa  226  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 771 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 743 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 758 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 838 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 730 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 759 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 746 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 774 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 780 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 796 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 729 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 809 aa  214  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 751 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 812 aa  213  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 722 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 741 aa  208  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 723 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 773 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 732 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 863 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 777 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 771 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 829 aa  202  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 803 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 796 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 775 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 784 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 773 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 773 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 733 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 761 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 764 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 862 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 767 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 783 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 789 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 803 aa  197  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 839 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 867 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 765 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 749 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 903 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 780 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 790 aa  194  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 794 aa  191  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 786 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 775 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 800 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 800 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 772 aa  191  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 783 aa  190  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 725 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.16 
 
 		 754 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  27 
 
 		 789 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 753 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 733 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 747 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 856 aa  188  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 789 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>