More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0250 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 763 aa  1539    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  39.97 
 
 		 759 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 771 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 756 aa  364  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 773 aa  324  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 771 aa  319  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 773 aa  316  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 758 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 747 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 726 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 785 aa  307  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 732 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 755 aa  306  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 743 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 725 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 761 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 792 aa  300  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 794 aa  299  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 734 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 764 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 704 aa  298  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 782 aa  298  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 773 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 741 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 730 aa  290  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 779 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 737 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 730 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 783 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 822 aa  283  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 720 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 803 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 763 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 722 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 790 aa  277  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 710 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 730 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 729 aa  273  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 764 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 743 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 746 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 758 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 733 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 775 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 777 aa  270  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 784 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 780 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 733 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 776 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 722 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 771 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 780 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 748 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 780 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 765 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  32.92 
 
 		 739 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 726 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 764 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 743 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 757 aa  257  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 695 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 728 aa  256  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 787 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 717 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 769 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 777 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 767 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 774 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 773 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 809 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 736 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 796 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 857 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 757 aa  247  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 755 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 764 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 789 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 763 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 724 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 758 aa  243  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 775 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 755 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 790 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  31.98 
 
 		 733 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 761 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 804 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 700 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 753 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 810 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 771 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 786 aa  238  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 794 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 745 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 731 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>