More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0484 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 723 aa  1464    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 729 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 734 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 704 aa  334  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 765 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 771 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 731 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 755 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 730 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 747 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 710 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 777 aa  278  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 728 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 732 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 720 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 744 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 766 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 790 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 761 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 737 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 780 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 726 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 762 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 730 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 722 aa  250  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 725 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 738 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 735 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 761 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 780 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 759 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 803 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 728 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 749 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 792 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 867 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 775 aa  244  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.13 
 
 		 754 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 763 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 764 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 730 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 743 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 764 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 767 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 743 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 736 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 769 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 741 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.56 
 
 		 715 aa  233  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 776 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 743 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 785 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 777 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 		 739 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 795 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 724 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 794 aa  226  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 755 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 779 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 773 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 756 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 746 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 807 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 761 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 722 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 782 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.1 
 
 		 741 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 771 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 773 aa  220  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 771 aa  220  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 751 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 758 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 787 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 796 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 702 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 755 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 800 aa  217  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 800 aa  217  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 713 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 773 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 753 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 822 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 857 aa  212  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 796 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 926 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.16 
 
 		 733 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 751 aa  210  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 784 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 770 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 810 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 733 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 731 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 745 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>