More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3785 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  49.79 
 
 		 743 aa  713    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 748 aa  1508    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  46.6 
 
 		 737 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 764 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 746 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 759 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 763 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 771 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 755 aa  239  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  30.34 
 
 		 733 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 783 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 773 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 725 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 756 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 773 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 771 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 795 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 773 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 789 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 777 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 720 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 743 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 758 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 803 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 730 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 730 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 809 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 747 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 710 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 761 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 775 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 730 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.75 
 
 		 739 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 759 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 717 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 758 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 723 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 789 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 794 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 778 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 732 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 767 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 722 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 778 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 765 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 790 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 779 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 757 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 704 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 757 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 767 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 780 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 766 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 785 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 744 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 797 aa  187  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 773 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 784 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 758 aa  184  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 774 aa  184  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 779 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 776 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 755 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 749 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 757 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 822 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 734 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 937 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 750 aa  180  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  25.07 
 
 		 738 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 735 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 785 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 764 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 771 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 767 aa  177  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 722 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 758 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 761 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 758 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 771 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 780 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 789 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 728 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 728 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 784 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 702 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 754 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>