More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1542 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  44.43 
 
 		 804 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 779 aa  1587    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  38.12 
 
 		 759 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  38.97 
 
 		 771 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 799 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 858 aa  352  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 853 aa  335  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  32.74 
 
 		 797 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  31.77 
 
 		 807 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  31.45 
 
 		 763 aa  308  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 761 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 794 aa  297  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 780 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 784 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 730 aa  280  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 792 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 787 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 784 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 755 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  32.01 
 
 		 739 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 803 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 704 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 790 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 796 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 710 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 734 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 736 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 783 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 741 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 743 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 780 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 773 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 785 aa  236  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 771 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 817 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 765 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 790 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 773 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 728 aa  231  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 726 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 761 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 749 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 728 aa  224  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 765 aa  221  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 856 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 733 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 766 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 720 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 753 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 775 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 754 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 732 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 759 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 780 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 722 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 747 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 777 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 745 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 809 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 763 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 786 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 722 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 730 aa  197  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  26.9 
 
 		 850 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 771 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 758 aa  194  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 750 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 		 741 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 764 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 758 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 729 aa  188  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 808 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 743 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.81 
 
 		 755 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 759 aa  185  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 755 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 733 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 774 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 730 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 775 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 741 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 761 aa  180  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 770 aa  177  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 758 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25.92 
 
 		 751 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 743 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 757 aa  175  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 746 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 764 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 731 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 758 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 751 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 786 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 790 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>