More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4100 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 985 aa  2011    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  43.15 
 
 		 937 aa  754    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 971 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 969 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 817 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 748 aa  165  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 860 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 903 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 867 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 795 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 758 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  39.27 
 
 		 744 aa  154  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 825 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  36.55 
 
 		 739 aa  151  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 704 aa  148  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 851 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 731 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 779 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 777 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 758 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 796 aa  145  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 765 aa  144  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 859 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  38.42 
 
 		 783 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 795 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 804 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 767 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 713 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 777 aa  141  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 		 710 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3422  TonB-dependent receptor, plug  33.64 
 
 		 345 aa  139  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209041  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  35.63 
 
 		 487 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  31.78 
 
 		 715 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 723 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 854 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 720 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 769 aa  135  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  39.05 
 
 		 775 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 755 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 738 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  38.32 
 
 		 736 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 766 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 734 aa  131  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 		 764 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 		 695 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 749 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 896 aa  130  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 789 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 		 780 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 817 aa  130  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 822 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 764 aa  128  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 724 aa  128  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 773 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 790 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 791 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 		 797 aa  126  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 783 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 765 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 792 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 794 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 732 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 776 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 757 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 785 aa  125  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 763 aa  125  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 758 aa  125  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 771 aa  125  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 800 aa  124  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 800 aa  124  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 880 aa  124  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 775 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 751 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 753 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 797 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 857 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 733 aa  122  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 790 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 728 aa  122  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 796 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 729 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 763 aa  121  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 783 aa  121  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 798 aa  120  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 767 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 733 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 844 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 755 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 773 aa  119  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 815 aa  119  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  34.69 
 
 		 809 aa  119  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 778 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 741 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  32.39 
 
 		 748 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>