More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3562 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 747 aa  1523    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 766 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 789 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 744 aa  306  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 794 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 808 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 807 aa  276  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 758 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 733 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 722 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 710 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 735 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 759 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 796 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 730 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 783 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 722 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 704 aa  234  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 717 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 738 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 726 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 757 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 749 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 786 aa  225  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 785 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 780 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 732 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 747 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 734 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 739 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 775 aa  214  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 764 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 763 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 809 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 726 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 825 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 754 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 741 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 794 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 784 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 787 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 782 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 720 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 824 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 756 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  27.08 
 
 		 797 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 731 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 730 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 789 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 731 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 759 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 729 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 753 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 776 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 808 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 769 aa  193  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 761 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 903 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 771 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 761 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 743 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 736 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 761 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 731 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 817 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 777 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 803 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 840 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 792 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 873 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 723 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 785 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.97 
 
 		 755 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 743 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 843 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 755 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 790 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 761 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 737 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 772 aa  181  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 741 aa  180  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 794 aa  180  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 764 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 773 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 745 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 769 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 751 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 730 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.02 
 
 		 741 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 814 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 786 aa  174  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 796 aa  173  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 700 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>