More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1066 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  46.75 
 
 		 841 aa  731    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 844 aa  1722    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  48.33 
 
 		 818 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 767 aa  293  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 732 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 737 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 695 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 713 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 702 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 718 aa  197  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 703 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 775 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 790 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 779 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 759 aa  147  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 797 aa  146  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 853 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 730 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 		 700 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 730 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 729 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 726 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.47 
 
 		 739 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 730 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 771 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 969 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 731 aa  127  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 851 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 736 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 720 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 875 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 733 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 985 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 754 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  38.17 
 
 		 829 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 		 774 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 851 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 853 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 815 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 784 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  21.72 
 
 		 755 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  23.38 
 
 		 797 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 858 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 732 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 751 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  34.27 
 
 		 715 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 789 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 796 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 717 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 792 aa  110  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 777 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 903 aa  109  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  22.77 
 
 		 822 aa  108  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 731 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 763 aa  108  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 752 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 761 aa  107  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 789 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 787 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 809 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 		 756 aa  105  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 757 aa  104  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 730 aa  104  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 807 aa  104  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 779 aa  104  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 761 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 773 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 		 755 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.64 
 
 		 754 aa  102  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 685 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 758 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 862 aa  100  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 859 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 783 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 704 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 919 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 867 aa  99.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  28.44 
 
 		 797 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 803 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 769 aa  99.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 710 aa  100  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 763 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 747 aa  99.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 766 aa  99.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 796 aa  98.6  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 738 aa  98.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 777 aa  98.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  29.11 
 
 		 809 aa  98.2  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 773 aa  98.2  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 784 aa  97.8  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 814 aa  97.8  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 759 aa  97.8  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 778 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 724 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>