More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2612 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 807 aa  1626    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  42.56 
 
 		 757 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  39.52 
 
 		 762 aa  525  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 780 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 780 aa  313  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 802 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 763 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 781 aa  300  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 791 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 786 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 806 aa  288  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 753 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 747 aa  280  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 785 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 795 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  30.91 
 
 		 889 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 771 aa  266  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 784 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 734 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 792 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 808 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 802 aa  230  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 752 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 742 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 797 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.9 
 
 		 822 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 795 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 856 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 777 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 763 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 777 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 883 aa  202  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 788 aa  202  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 730 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  25.23 
 
 		 846 aa  193  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 751 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 886 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 875 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 712 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 798 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 766 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 904 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  26.15 
 
 		 830 aa  181  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 795 aa  180  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 808 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 803 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 794 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 763 aa  170  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 787 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 704 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 794 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 741 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 777 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 746 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 710 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 713 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 739 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 796 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 724 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 808 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 690 aa  153  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 825 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 755 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 809 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 829 aa  151  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 729 aa  150  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 722 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 702 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 732 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 747 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 743 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 732 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 690 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 818 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 797 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 733 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 769 aa  144  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 784 aa  144  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 807 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 695 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 735 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 774 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 769 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 775 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 780 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 755 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 700 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 785 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 779 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 779 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 		 797 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 734 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  24.41 
 
 		 741 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>