More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4696 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 763 aa  1553    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  77.29 
 
 		 776 aa  1172    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  48.32 
 
 		 731 aa  675    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  72.16 
 
 		 761 aa  1106    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  44.7 
 
 		 758 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  45.56 
 
 		 742 aa  589  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  42.95 
 
 		 777 aa  581  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 		 757 aa  499  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 769 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  40.46 
 
 		 754 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  40.14 
 
 		 738 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 763 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 759 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 747 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 766 aa  230  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 773 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 771 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 764 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 725 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 737 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 794 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 773 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 785 aa  214  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 755 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 782 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 802 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.86 
 
 		 755 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 761 aa  200  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 759 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 730 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 803 aa  197  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 756 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 710 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 741 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 736 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 722 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 744 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 808 aa  188  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 695 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 779 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 743 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 761 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 809 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 778 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 788 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 730 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 749 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 755 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 755 aa  183  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 757 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 741 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 722 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 726 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 720 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 771 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 778 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 825 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 734 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 795 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 767 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 767 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 853 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 704 aa  178  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 758 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.94 
 
 		 739 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 789 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  26.58 
 
 		 797 aa  177  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 764 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 789 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 804 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 784 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 796 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 851 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 780 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 754 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 755 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 746 aa  174  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 758 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 764 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  29.08 
 
 		 822 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 730 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 792 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 700 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 753 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 817 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 790 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 733 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 751 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 785 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 763 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 		 797 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 733 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 767 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>