More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1941 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1941  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 676 aa  1379    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.891675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 798 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 854 aa  270  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 775 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 777 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 795 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 765 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 759 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 785 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 755 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 758 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 747 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 817 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 803 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 743 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 704 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 776 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 790 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 763 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 817 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 782 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 784 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 730 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 748 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 753 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 732 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 730 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 762 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 773 aa  164  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 739 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 794 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 794 aa  161  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 761 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 771 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 774 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 755 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 832 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 758 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 773 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 774 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 771 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 758 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.9 
 
 		 754 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 743 aa  154  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 758 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 751 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 784 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 758 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 744 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 803 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 773 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 763 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 749 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 779 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 722 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 769 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 763 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 780 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 799 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 746 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 738 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 733 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 778 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 713 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 755 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 723 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 807 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 780 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 722 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 750 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 737 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 766 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 761 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 790 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 767 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 758 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 792 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 710 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 733 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 780 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.48 
 
 		 822 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 759 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 756 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 747 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 792 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 778 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 730 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 729 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.76 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 735 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 787 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 790 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 822 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>