More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08200 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  74.13 
 
 		 786 aa  1112    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  82.96 
 
 		 803 aa  1282    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  66.21 
 
 		 790 aa  960    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  76.34 
 
 		 778 aa  1163    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  65.55 
 
 		 790 aa  959    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 767 aa  1556    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  76.88 
 
 		 778 aa  1145    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  45.76 
 
 		 771 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  42.3 
 
 		 800 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  42.3 
 
 		 800 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  41.28 
 
 		 773 aa  522  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 		 756 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  38.99 
 
 		 734 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 808 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 814 aa  366  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 854 aa  326  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 855 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 815 aa  324  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 848 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 832 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 873 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 761 aa  299  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 720 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 851 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  31.94 
 
 		 878 aa  283  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  31.02 
 
 		 755 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 833 aa  277  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 741 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 798 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 764 aa  267  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 783 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 780 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 732 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 797 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 864 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 780 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 903 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 757 aa  238  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 777 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 794 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 710 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 783 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 763 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 751 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 747 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 838 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 755 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 755 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 860 aa  220  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 729 aa  220  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 769 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 736 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 761 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 788 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 722 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 862 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 784 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 690 aa  215  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 790 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 		 839 aa  214  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 690 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 815 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 780 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 776 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 730 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 783 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 734 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 713 aa  207  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 769 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 790 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 788 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 739 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 756 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 745 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 722 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 763 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 797 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 807 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 792 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 773 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 749 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 741 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 796 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 763 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 779 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 794 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 765 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 785 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 723 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 720 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 775 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 704 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 851 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 787 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>