More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2057 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  100 
 
 
728 aa  1481    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 
745 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 
759 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 
743 aa  429  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  37.22 
 
 
750 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 
770 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 
774 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 
758 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 
758 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 
758 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 
758 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 
786 aa  395  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 
771 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  35.32 
 
 
792 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 
761 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 
704 aa  308  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 
765 aa  304  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 
790 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 
792 aa  296  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 
776 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
803 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 
755 aa  293  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 
780 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 
720 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 
780 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 
775 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 
790 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 
761 aa  276  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
730 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 
807 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 
723 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 
741 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 
710 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
730 aa  264  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
726 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
773 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 
771 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 
732 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 
734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 
764 aa  254  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
773 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 
736 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
728 aa  250  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
787 aa  250  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 
739 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
796 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.75 
 
 
755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 
784 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
758 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.95 
 
 
754 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
783 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
785 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
730 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
729 aa  241  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
753 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 
749 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
771 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 
755 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
794 aa  235  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28 
 
 
722 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
779 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 
741 aa  230  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
832 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 
788 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 
761 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
771 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 
747 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
751 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 
778 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
730 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 
799 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
771 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
775 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 
751 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 
784 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 
778 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.17 
 
 
759 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 
726 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 
741 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
762 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
779 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
777 aa  211  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
780 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
773 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
733 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 
797 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
803 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 
794 aa  206  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
790 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
790 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
777 aa  203  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
724 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 
774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
769 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
737 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 
769 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 
713 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 
767 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 
743 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
800 aa  196  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>