More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3263 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  69.66 
 
 		 859 aa  1232    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  58.93 
 
 		 867 aa  961    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 860 aa  1744    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  53.77 
 
 		 851 aa  910    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  36.85 
 
 		 780 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 803 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 832 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 790 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 792 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 790 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 807 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 780 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 761 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 784 aa  294  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 856 aa  293  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 794 aa  285  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 775 aa  255  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 780 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 817 aa  240  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 769 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 759 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 758 aa  228  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 782 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 756 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 825 aa  221  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  40.29 
 
 		 776 aa  217  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 754 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 807 aa  211  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 806 aa  208  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 779 aa  205  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 761 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 758 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 741 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 789 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 850 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 736 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 862 aa  185  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 749 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 800 aa  184  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 800 aa  184  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 969 aa  184  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 791 aa  174  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 784 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 795 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  39.84 
 
 		 743 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 710 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  49.43 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 937 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 786 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 903 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  38.02 
 
 		 797 aa  163  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 		 745 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 796 aa  160  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 730 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 704 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 985 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 754 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 738 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 815 aa  157  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 733 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 817 aa  157  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 787 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  43.94 
 
 		 728 aa  156  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 812 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  42.53 
 
 		 804 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 792 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  31.5 
 
 		 759 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 764 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 810 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 730 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 771 aa  154  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 896 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 763 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 835 aa  150  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 750 aa  150  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 864 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 774 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  32.59 
 
 		 751 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  44.69 
 
 		 809 aa  150  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  36.89 
 
 		 770 aa  149  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 971 aa  148  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 720 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  32.28 
 
 		 763 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 744 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  40.27 
 
 		 723 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 838 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 734 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 759 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  39.05 
 
 		 755 aa  145  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 851 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  31.23 
 
 		 906 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>