More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5246 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 762 aa  1535    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  44.25 
 
 		 757 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  39.52 
 
 		 807 aa  525  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 763 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  30.66 
 
 		 785 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 791 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 753 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 802 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  32.41 
 
 		 889 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 780 aa  270  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 780 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 781 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 771 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 777 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 792 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  30.39 
 
 		 822 aa  251  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  29.49 
 
 		 784 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 795 aa  247  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 786 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 802 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 795 aa  244  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 747 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 712 aa  234  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 808 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 752 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 806 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 734 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 797 aa  211  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 795 aa  207  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  29.8 
 
 		 856 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 777 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 875 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 774 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 690 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 788 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 690 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 742 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 720 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 798 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 904 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 851 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 720 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 695 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 779 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 847 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 775 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 769 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 790 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 724 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 780 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 753 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 704 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 734 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 783 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 830 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.94 
 
 		 715 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 695 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  25.64 
 
 		 846 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 733 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 729 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 825 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 687 aa  161  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 728 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 730 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 767 aa  158  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 713 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 735 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 794 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 784 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 803 aa  154  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 733 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 737 aa  154  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 780 aa  153  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 709 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 766 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 785 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 794 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 792 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 751 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 756 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 725 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 886 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 758 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 723 aa  148  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 747 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 778 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 729 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.88 
 
 		 754 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 777 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 		 741 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 733 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 790 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 804 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 743 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>