More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2440 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 688 aa  1391    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  45.49 
 
 		 741 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  45.29 
 
 		 649 aa  568  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  43.21 
 
 		 684 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 713 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 710 aa  210  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 733 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 702 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 790 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 790 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 730 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 803 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 755 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 729 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 779 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 700 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 726 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 704 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 732 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 778 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 809 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 731 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 785 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 769 aa  161  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 724 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 764 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.03 
 
 		 755 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 751 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 725 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 767 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54950  hypothetical protein  30.84 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000722946  unclonable  3.2012599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 778 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 734 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 777 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 732 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 848 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 794 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 761 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 780 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 765 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 687 aa  151  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 783 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 817 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 743 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 695 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 739 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.26 
 
 		 776 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 798 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 741 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 759 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 853 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 718 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 761 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 771 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 851 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 851 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 808 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 762 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  24.2 
 
 		 878 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 780 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.68 
 
 		 715 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54960  hypothetical protein  39.02 
 
 		 322 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000341506  unclonable  2.05856e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 822 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 785 aa  140  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 776 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 747 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 758 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 705 aa  138  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 779 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 773 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 717 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 662 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 769 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 713 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 795 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 784 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 730 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 703 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 722 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 705 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  24.63 
 
 		 829 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 802 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 765 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 809 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 873 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 669 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 728 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 804 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 767 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>