More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54960  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000341506  unclonable  2.05856e-21 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 688 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 684 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 764 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 724 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 730 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 713 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  33.75 
 
 		 906 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  30.61 
 
 		 862 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 803 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 769 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 741 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 731 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 817 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 864 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  33.33 
 
 		 755 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 785 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 779 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 774 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 751 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  35.59 
 
 		 720 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 937 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 767 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 771 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 761 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 713 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 790 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 767 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 790 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 785 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 710 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 778 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 773 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  34.12 
 
 		 739 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 		 755 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 783 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 710 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 741 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 680 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 838 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3422  TonB-dependent receptor, plug  35.89 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209041  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 786 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 798 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 810 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 695 aa  96.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 903 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 755 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 766 aa  95.9  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 822 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 779 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 764 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 777 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 762 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 764 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  40.68 
 
 		 736 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  32.31 
 
 		 797 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 778 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 687 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 732 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 763 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 783 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 761 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 717 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 700 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 853 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 795 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 758 aa  92.4  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 744 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 926 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 775 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 730 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 776 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 723 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 971 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 873 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  33.18 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 731 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 985 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 649 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 779 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 743 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 759 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 807 aa  89.7  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 735 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 729 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 829 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 745 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 725 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 809 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 797 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 764 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  32.58 
 
 		 763 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 695 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 694 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  33.89 
 
 		 776 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 800 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 800 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 803 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 790 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 730 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>