More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2161 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 729 aa  1478    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 763 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 687 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 720 aa  171  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 762 aa  170  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 720 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 690 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 792 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 690 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 710 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.35 
 
 		 715 aa  154  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 695 aa  154  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 713 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 751 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 730 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 802 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 769 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.77 
 
 		 739 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 771 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 713 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 729 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 737 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 718 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 761 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 704 aa  135  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.08 
 
 		 767 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 780 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 778 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 732 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 753 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  26.26 
 
 		 691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 722 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 766 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 728 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 717 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 700 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 783 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 695 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 787 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 749 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 778 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 793 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 761 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 794 aa  124  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 803 aa  124  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 734 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 732 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 753 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 758 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.84 
 
 		 784 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 748 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 731 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 757 aa  120  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 724 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 744 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 747 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 		 754 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 733 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 771 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 777 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 761 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 741 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 764 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 776 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 720 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.07 
 
 		 755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 786 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 809 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 732 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 777 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 790 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 774 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 775 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 733 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 784 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 758 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 703 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 722 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 759 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 688 aa  113  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 		 751 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 680 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  24.42 
 
 		 856 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 713 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 783 aa  110  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 649 aa  110  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 825 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 779 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  21.81 
 
 		 748 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 730 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>