More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1887 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  58.01 
 
 		 854 aa  961    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  54.5 
 
 		 873 aa  941    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 848 aa  1712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  62.14 
 
 		 851 aa  1057    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  61.63 
 
 		 855 aa  1051    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  57.81 
 
 		 878 aa  953    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  43.25 
 
 		 808 aa  635  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  43.9 
 
 		 814 aa  592  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 803 aa  336  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 767 aa  327  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 835 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 800 aa  300  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 800 aa  300  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 786 aa  297  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 790 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 790 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 778 aa  295  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 778 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 771 aa  264  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 903 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 815 aa  252  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 832 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 720 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 741 aa  230  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 798 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.64 
 
 		 755 aa  227  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 796 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 815 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 792 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 896 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 777 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 794 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 726 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 761 aa  210  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 763 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 838 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 730 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 790 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 784 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 864 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 756 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 734 aa  206  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 833 aa  206  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 773 aa  205  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 765 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 790 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 761 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 919 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 753 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 741 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 710 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 817 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 747 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 761 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 794 aa  195  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 775 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 776 aa  194  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 723 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 784 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 722 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 757 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 763 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 780 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 858 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 780 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 762 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 734 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 797 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 745 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 730 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 862 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 755 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 743 aa  179  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.23 
 
 		 739 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 755 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 773 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 783 aa  177  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 736 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 771 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 809 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 787 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 803 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 771 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 859 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 729 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 725 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 759 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 764 aa  170  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 860 aa  170  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 783 aa  170  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 728 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 779 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 807 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>