More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2250 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  68.36 
 
 		 855 aa  1163    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  56.26 
 
 		 873 aa  999    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  45.01 
 
 		 808 aa  646    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 851 aa  1728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  61.91 
 
 		 854 aa  1046    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  58.66 
 
 		 878 aa  929    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 848 aa  1059    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  43.35 
 
 		 814 aa  601  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 835 aa  340  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 800 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 800 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 790 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 790 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 803 aa  301  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 786 aa  300  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 778 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 767 aa  295  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 778 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 771 aa  278  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 815 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 732 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 903 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 815 aa  238  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 832 aa  234  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 741 aa  230  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 796 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.06 
 
 		 755 aa  221  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 833 aa  219  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 862 aa  218  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 769 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 726 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 756 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 919 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 794 aa  213  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 704 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 777 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 734 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 734 aa  211  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 790 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 730 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 761 aa  207  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 794 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 747 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 763 aa  204  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 792 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 790 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 710 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 773 aa  201  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 761 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 864 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 780 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 761 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 741 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 784 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 		 739 aa  194  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 838 aa  194  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 753 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 743 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 765 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 880 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 798 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 722 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 797 aa  188  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 775 aa  188  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 787 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 862 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 860 aa  185  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 817 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 751 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 788 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 755 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 749 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 728 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 717 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 896 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 729 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 730 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 759 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 757 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  41.78 
 
 		 720 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 730 aa  179  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 776 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 807 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 723 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 779 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 780 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 783 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 726 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 788 aa  174  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 725 aa  173  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 743 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  28.28 
 
 		 906 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 769 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 771 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 771 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>