176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3378 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  759    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  52.29 
 
 
373 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  49.19 
 
 
382 aa  359  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  49.19 
 
 
387 aa  356  5e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  48.11 
 
 
383 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  47.84 
 
 
384 aa  349  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  48.77 
 
 
371 aa  346  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  46.76 
 
 
387 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  46.76 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  47.98 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  46.49 
 
 
388 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  46.76 
 
 
387 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  46.79 
 
 
372 aa  318  9e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  47.04 
 
 
392 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  46.05 
 
 
380 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  42.07 
 
 
396 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  46.01 
 
 
382 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  45.43 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  44.88 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  40.72 
 
 
381 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  44.09 
 
 
393 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  39.78 
 
 
383 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  44.09 
 
 
393 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  38.63 
 
 
381 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  37.1 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  37.67 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  33.43 
 
 
362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  33.86 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  34.69 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  33.24 
 
 
376 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  33.79 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  33.88 
 
 
349 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  37.03 
 
 
372 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  33.79 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  35.42 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  34.25 
 
 
355 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  34.25 
 
 
355 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  33.79 
 
 
351 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  34.41 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  31.73 
 
 
366 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  32.27 
 
 
366 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  31.98 
 
 
386 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  30.19 
 
 
359 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  31.91 
 
 
368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  31.55 
 
 
386 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  30.56 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  31.42 
 
 
360 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  30.96 
 
 
360 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  32.59 
 
 
359 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  31.71 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  31.48 
 
 
359 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  30.19 
 
 
371 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  27.2 
 
 
370 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  29.53 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  29 
 
 
360 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  26.12 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  27.4 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  27.82 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  24.53 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  25.75 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1233  alanine racemase domain protein  26.3 
 
 
371 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  25.2 
 
 
376 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  26.37 
 
 
378 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  26.05 
 
 
379 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  26.33 
 
 
393 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  26.89 
 
 
375 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  25 
 
 
378 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  26.56 
 
 
376 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  24.87 
 
 
376 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  24.47 
 
 
376 aa  99.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  26.65 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  26.13 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  27.23 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  28.69 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  26.56 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  25.83 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  28.14 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  25.34 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  26.22 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  27.78 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  28.38 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  26.01 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  24.73 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  25.27 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  24.8 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  23.28 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  23.46 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  27.32 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  25.14 
 
 
417 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  26.61 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  24.04 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  27.93 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  24.25 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2485  alanine racemase domain protein  25.81 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  22.53 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  25.94 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  26.45 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4895  putative D-serine ammonia-lyase  24.51 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.333429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0964  D-serine deaminase  24.19 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000714853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  25.07 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>